Na região da Laguna dos Patos, Lago Guaíba e Rio Jacuí, há 3 locais para fundeio:
ÁREA ALFA: Laguna dos Patos
A Área Alfa está localizada na Laguna dos Patos próximo ao Farol de Itapuã. Destina-se às embarcações que não podem trafegar, no período noturno, pelo lago Guaíba.
Está localizada na parte frontal do Cais Mauá e destina-se, independentemente do tipo de carga transportada, por espera por vaga nos terminais, pela abertura do vão móvel e/ou visita de autoridades portuárias (Receita Federal, Polícia Federal, Vigilância Sanitária).
Situada nas proximdades do canal de acesso ao Terminal Santa Clara, destina-se às embarcações de até 150 metros de comprimento que transportam carga perigosa.